15 avr. 2019
Par Blog : Le blog de Jean Vinçot

A quoi va servir un séquençage prénatal des gènes de l'autisme ?

 

spectrumnews.org - Traduction de "Prenatal sequencing for some autism genes may soon be available"

Le séquençage prénatal de certains gènes de l'autisme pourrait bientôt être disponible

par Jessica Wright / 10 avril 2019

Mother Nature's Rules © Luna TMG
Mother Nature's Rules © Luna TMG


Le séquençage permet d'identifier les mutations liées à l'autisme avant même la naissance d'un enfant - surtout dans les cas où les médecins soupçonnent des problèmes, selon deux nouvelles études 1,2.

Dans les études, les scientifiques n'ont séquencé l'ADN fœtal que lorsque les ultrasons ont révélé un développement atypique des membres ou d'autres organes, et ils ont donné aux familles uniquement les résultats qui semblaient expliquer ces problèmes.

Mais il y a un risque réel que d'autres personnes utilisent cette technique pour tester les mutations chez n'importe quel fœtus - et pour transmettre tous les résultats aux parents - sans supervision adéquate, dit Ronald Wapner, professeur en obstétrique et gynécologie au Columbia Institute for Genomic Medicine, qui a dirigé une des études.

"Ce n'est pas n'importe qui qui devrait le faire ; cela devrait être entre les mains de gens qui sont experts ", dit-il.

D'autres types d'analyses détectent déjà des mutations chez le fœtus : certaines détectent les grands segments d'ADN qui sont échangés entre les chromosomes, tandis que d'autres peuvent détecter les copies manquantes ou dupliquées de fragments d'ADN.

Les nouvelles études sont parmi les premières à détecter les mutations dans l'exome fœtal - essentiellement, la collecte de gènes dans un génome.

Ce domaine est rempli de questions éthiques, notamment celle de savoir si les parents pourraient choisir d'interrompre une grossesse en fonction des résultats. Mais les chercheurs notent que la plupart des mutations qu'ils ont trouvées posent de graves risques pour la santé, qui pourraient être traités à la naissance ou in utero.

"Je pense que beaucoup de gens ont l'idée fausse que ces tests sont faits pour décider s'il faut ou non mettre fin à une grossesse ", dit Christa Lese Martin, directrice du Autism and Developmental Medicine Institute Geisinger à Lewisburg, en Pennsylvanie, qui ne participait pas aux études. "Pour moi, c'est donner de l'information aux familles et aux médecins pour qu'ils puissent planifier la grossesse, l'accouchement et mieux identifier les besoins de la famille et du bébé."

Résultat significatif

L'équipe de Wapner a étudié 234 fœtus présentant des anomalies détectables à l'échographie, comme des membres raccourcis, un excès de liquide cérébral ou un rein mal formé. Les tests génétiques standard n'avaient fourni aucune explication pour les résultats de l'échographie.

Dans la plupart des cas, les chercheurs ont séquencé les exomes fœtaux à partir des cellules du liquide amniotique, du sang du cordon ombilical ou du placenta ; dans d'autres cas, ils ont prélevé l'ADN après la naissance. Dans 24 cas, ils ont trouvé une mutation qui expliquait l'anomalie des ultrasons.

Dans la deuxième étude, les chercheurs ont recruté 610 femmes enceintes dans 34 cliniques du Royaume-Uni. Ils ont séquencé 1.628 gènes associés au retard du développement et ont mis en évidence des mutations liées aux résultats des ultrasons chez 52 fœtus. Ils n'ont communiqué ces résultats aux parents qu'après la naissance.

Ensemble, les deux études, parues en février dans The Lancet, ont identifié des mutations chez 15 fœtus dans l'un des neuf gènes de l'autisme, dont TSC2, ANKRD11 et SCN2A. Ils ont également découvert de nouveaux liens entre ces gènes et des problèmes anatomiques. Par exemple, l'équipe de Wapner a découvert une mutation nocive connue du SCN2A chez un fœtus présentant un excès de liquide cérébral, un lien signalé une fois auparavant.

Les deux études ont porté sur toutes les femmes qui ont fréquenté une clinique au cours d'une période donnée. Ensemble, ils impliquent que le séquençage peut identifier une cause génétique des anomalies de l'échographie dans environ 10 % des cas.

Les résultats suggèrent que le séquençage prénatal devrait être utilisé en clinique, dit Michael Talkowski, professeur agrégé de neurologie à l'Université Harvard, qui n'a pas participé aux études. Les études antérieures sur le séquençage prénatal étaient " aléatoires et n'ont pas été effectuées de façon identique ", dit-il, alors que les nouvelles études fournissent une référence plus fiable. Talkowski travaille sur le séquençage de l'ensemble du génome fœtal, ce qui pourrait donner de meilleurs résultats, mais ce travail est préliminaire.

De l'ADN flottant

L'extraction des cellules fœtales comporte un léger risque de fausse couche. Une troisième étude décrit une approche moins invasive - le séquençage de l'ADN fœtal dans le sang de la mère3.

À l'aide de cet ADN " sans cellules ", les chercheurs ont séquencé 30 gènes associés à des maladies graves comme le syndrome de Noonan, qui est lié à l'autisme ; 14 de ces gènes ont des liens avec l'autisme. Certains problèmes associés à ces conditions, comme les malformations cardiaques, peuvent être traités avant ou juste après la naissance.

Les chercheurs ont identifié une mutation chez 32 des 422 fœtus ; six des mutations sont dans l'un des trois gènes liés à l'autisme. Ils ont jusqu'à présent confirmé la présence de la mutation dans 20 de ces cas après la naissance, ils l'ont rapporté en janvier dans Nature Medicine.

Ce test peut être effectué dès la neuvième semaine de grossesse, avant que la plupart des anomalies ne soient visibles à l'échographie, ce qui offre la possibilité d'une intervention précoce, explique Jinglan Zhang, qui a dirigé cette étude.

Les techniques d'analyse de l'ADN sans cellules ne détectent de façon fiable que trois anomalies chromosomiques ; le séquençage peut n'analyser que quelques dizaines de gènes et décourager les parents d'essayer d'autres tests qui pourraient donner des résultats plus instructifs.

L'American College of Medical Genetics and Genomics a établi des lignes directrices pour informer les femmes sur les limites des tests sans cellules4, mais selon une étude réalisée en avril, les organismes ne respectent pas tous ces lignes directrices5.

Références:

  1. Petrovski S. et al. Lancet 393, 758-767 (2019) PubMed
  2. Lord J. et al. Lancet 393, 747-757 (2019) PubMed
  3. Zhang J. et al. Nat. Med. Epub ahead of print (2019) PubMed
  4. Gregg A.R. et al. Genet Med. 15, 395-398 (2013) PubMed
  5. Skotko B.G. et al. Genet. Med. Epub ahead of print (2019) PubMed